Воскресенье, 17 сентября, 9.00–11.00

Зал «Парламент», Президент-Отель

 

9.00 – 9.20

Взаимодействие РНК и ДНК в хроматине. Анастасия Жарикова, Александра Галицына, Алексей Гаврилов, Андрей Миронов, Сергей Разин

9.20 – 9.40

Detection of signal beyond secondary structure from SHAPE experiment. Alexandra Pogorelskaya, Andrew Mironov, Ruslan Soldatov

9.40 – 10.00                                     

Эволюция рибосомы у бактерий с короткими геномами. Дарья Николаева, Софья Гарушянц

10.00 – 10.20               

The signatures of recombination in the bdelloid rotifer Adineta vaga. Olga Vakhrusheva, Elena Mnatsakanova, Yan Galimov, Tatiana Neretina, Aleksey Penin, Maria Logacheva, Georgii Bazykin, Alexey Kondrashov

10.20 – 10.40

Negative selection in Drosophila melanogaster missense alleles. Nadezhda Potapova, Georgii Bazykin, Alexey Kondrashov

10.40 – 11.00

Inference of changes of fitness landscape from sequence data with single-position resolution. Galya Klink, Georgii Bazykin

 

Биоинформатика: Постерные доклады

Б1. Nascent DNA sequencing confirms replication initiation at a majority of potential human origins. Artem Artemov, Maria Andrianova, Georgii Bazykin, Vladimir Seplyarskiy

Б2. Comparative genomics of amino acid regulons and transporters in human gut Firmicutes. German Ashniev, Dmitry Rodionov

Б3. Accumulation of mutations in experimental evolution of basidiomycete fungus Schizophyllum commune. Aleksandra Bezmenova, Aleksey Penin, Artem Kasianov, Elena Zvyagina, Tatiana Neretina, Alexey Kondrashov

Б4. Evolution of Burkholderia spp. Olga Bochkareva, Elena Moroz, Iakov Davydov

Б5. Участие вторичной структуры РНК в регуляции альтернативного полиаденилирования. Данила Бредихин

Б6. Участие структуры РНК в регуляции альтернативного полиаденилирования. Данила Бредихин

Б7. Evidence of Balansing Selection in Parallel Evolution of Closely Related Gammarus Species Genomes. Valentina Burskaya, Sergey Naumenko, Georgii Bazykin

Б8. Влияние длительного космического полета на экспрессию генов в сердечной мышце мышей. Анна Валяева, Анастасия Жарикова, Андрей Миронов, Алексей Пенин, Олег Гусев, Мария Логачева, Анна Клепикова

Б9. Architecture of scientific data processing in a reproducible way using containers. Dmitriy Vinogradov, Andrey Zaika

Б10. Iron and zinc piracy: More evidence of co-evolution of bacteria and primates. Sofya Garushyants

Б11. Анализ дифференциальной экспрессии между стадиями клеточного цикла. Анастасия Жарикова

Б12. Репертуар белков, связанных с эпигенетикой. Иван Ильницкий, Анастасия Жарикова, Андрей Миронов

Б13. Обнаружение статистически значимых отличий в уровнях экспрессии генов больных раком. Татьяна Казакова

Б14. Evolutionary history of inversions in Streptococcus spp. Anna Karan, Olga Bochkareva, Pavel Shelyakin

Б15. In silico metabolic reconstruction of sugar utilization pathways in a large group of human gut Clostridia. Arthur Murtazin, Semen Leyn, Dmitry Rodionov

Б16. The analysis of conserved upstream open reading frames using comparative genomics. Kirill Prosvirov, Ruslan Soldatov, Stepan Denisov, Andrew Mironov

Б17. Genome rearrangements in Vibrio spp. Kirill Rudakov, Olga Bochkareva

Б18. Анализ кластеров пиРНК на основании данных сиквенсов библиотек малых РНК. Григорий Рябых, Анастасия Жарикова, Андрей Миронов

Б19. Interplay between chromatin contact frequency and expression levels in Drosophila melanogaster, Mus musculus and Homo sapiens genomes. Margarita Samborskaya, Ekaterina Khrameeva, Mikhail Gelfand, Andrew Mironov

Б20. Identification of genetic changes acquired by replicate lineages of Podospora anserina during long-term submerged cultivation. Ksenia Safina, Olga Vakhrusheva, Georgii Bazykin, Igor Mazheika, Ekaterina Budanova, Olga Kamzolkina, Olga Kudryavtseva, Alexey Kondrashov

Б21. Evidence for third family of gap junctions proteins in Echinodermata. Georgy Slivko-Koltchik, Victor Kuznetsov, Yuri Panchin

Б22. Взаимодействие эпигеномных меток определяет компартменты хроматина. Елена Ставровская, Александр Фаворов, Андрей Миронов

Б23. Классификация раковых образцов на основании зависимостеймутационных процессов от состояний хроматина. Елена Ставровская, Мария Андрианова, Надежда Тереханова, Александр Фаворов, Владимир Сеплярский

Б24. Сauses of single position fitness landscape changes. Anastasia Stolyarova, Elena Nabieva, Vasiliy Ptushenko, Georgii Bazykin

Б25. Genomics of rapid adaptation in populations of G.aculeatus and S.salar. Nadezhda Terekhanova

Б26. Закономерности преждевременной терминации трансляции у Escherichia coli. Зоя Червонцева

Б27. Genome rearrangements in Shigella spp. Anastasia Shkarina, Olga Bochkareva

Б28. Контекстно-зависимый отбор преждевременных старт-кодонов в линии Homo sapiens. Светлана Яровенко, Степан Денисов

Б29. Молодые сайты сплайсинга в геномах приматов: положительный отбор и изменения в экзон-интронной структуре генов. Светлана Яровенко, Степан Денисов

 

О платформе «Биоинформатика»:

В последние годы молекулярная биология переживает смену парадигмы — она становится, точнее, уже стала, наукой, богатой данными. Впервые оказывается возможным посмотреть на работу клетки в целом, проанализировать одновременно все метаболические пути или регуляторные взаимодействия. Биоинформатика является ключевым источником нового знания, получаемого из массовых, так называемых «омиксных» данных. При этом не просто решаются технические вопросы хранения и передачи огромных объемов данных, но и разрабатываются методы, позволяющие делать на основе этих данных содержательные биологические утверждения. С другой стороны, анализ таких данных позволяет предсказывать функции конкретных генов и то, как регулируется их работа.

В конечном счете, использование биоинформатических методов позволяет предсказывать свойства организма по его геному: эта задача уже может быть решена для бактерий. С фундаментальной же точки зрения, биоинформатика смыкается с молекулярной эволюцией и сравнительной геномикой в попытках понять механизмы эволюции белков, генов, регуляторных сетей и целых геномов.